Згідно з наказом МВС України від 12.10.2006 №847 пріоритет­ ними напрямками в роботі спеціальних підрозділів по боротьбі з організованою злочинністю вважаються:

- виявлення та припинення діяльності стійких суспільно не безпечних організованих груп і злочинних організацій, які впли вають на соціально-економічну та криміногенну ситуацію в ре­ гіонах і в державі, викриття злочинної діяльності їх лідерів та авторитетів;

- виявлення та розкриття серійних, резонансних злочинів, убивств «на замовлення», учинених стосовно народних депутатів України, державних службовців І-111 категорій, а також стосовно учасників ОТ і ЗО, злочинна діяльність яких викривалася спец підрозділами БОЗ у ході роботи у справах оперативного обліку;

- боротьба з корупцією й хабарництвом у сферах, які мають стратегічне значення дая економіки держави, серед вищих посадових осіб, працівників судових, правоохоронних та контролю ючих органів;